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Desarrollan una herramienta gratuita y colaborativa para clasificar microorganismos a partir de los metabolitos que producen

microbeMASST: Herramienta gratuita y colaborativa para identificar microorganismos por sus metabolitos. Acceso a 100M de compuestos

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15 Abril, 2024
Investigación

Se ha desarrollado una herramienta digital gratuita y colaborativa llamada microbeMASST para la identificación y análisis de microorganismos basados en los metabolitos que producen. Este proyecto, divulgado en Nature Microbiology el 11 de abril de 2024, ha sido resultado del esfuerzo conjunto de investigadores del IHSM La Mayora, un centro mixto de investigación entre el CSIC y la Universidad de Málaga, en colaboración con otras instituciones a nivel global.

La investigadora Alicia Pérez Lorente ha subrayado que microbeMASST se alinea con los principios de "ciencia abierta", ofreciendo acceso gratuito a grupos de investigación de todo el mundo. La plataforma, inicialmente compuesta por aproximadamente 60,000 monocultivos de microorganismos y especies, es colaborativa, permitiendo a otros grupos agregar nuevos registros para enriquecer continuamente la base de datos.

Pérez Lorente ha explicado que la herramienta permite la búsqueda por compuestos, mostrando qué microorganismos los contienen. Además, proporciona información detallada sobre más de 100 millones de compuestos provenientes de diversas bases de datos, junto con datos sobre el microorganismo, el medio y la temperatura de crecimiento, así como otros detalles relevantes sobre la muestra.

Por su parte, el investigador Carlos Molina ha destacado que microbeMASST presenta la información en forma de un árbol filogenético y permite identificar todos los microorganismos que producen el compuesto de interés, incluyendo bacterias, hongos, arqueas y células humanas.

Este proyecto, liderado por Pieter C. Dorrestein de la Universidad de California en San Diego, ha involucrado a profesionales de 77 instituciones de todo el mundo, siendo el equipo del IHSM La Mayora el único representante español en su creación. Además de Pérez Lorente y Molina, el catedrático de Microbiología de la Universidad de Málaga, Diego Romero, también ha contribuido al proyecto.

 

Fuente

Plan de Recuperación, Transformación y Resiliencia Financiado por la Unión Europea